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La constitución de los discos establecidos para los cluster de la escuela de Ingeniería Civil en Bioinformática está dada por a lo menos 3 discos que permitan la configuración en [[https://es.wikipedia.org/wiki/RAID|RAID]], siendo una de las razones a justificar este tipo de conformación la búsqueda de protección y rapidez a la hora de almacenar flujos de datos en disco. | La constitución de los discos establecidos para los clusters de cómputo de la escuela de Ingeniería Civil en Bioinformática, está normada por la implementación de a lo menos 3 discos que logren permitir la configuración en [[https://es.wikipedia.org/wiki/RAID|RAID]] 5, siendo una de las principales razones de justificación de está medida la búsqueda de protección y rapidez a la hora de almacenar flujos de datos (IN/OUT) en disco. |
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=== Formato de los discos === En la actualidad los discos duros poseen el formato de archivo [[https://es.wikipedia.org/wiki/Extended_file_system|ext]] en su versión 3 (clustertalca) y 4 (clustertalca2). La decisión de esto está tomada por la confianza que entrega el filesystem y el buen rendimiento que entrega en discos de tamaño no mayores a 4TB. Se estima conveniente explorar a futuro el formato XFS, que en ambientes de computación de alto rendimiento a logrado posicionarse con un filesystem de mucha confianza y excelente rendimiento. Referencia [[http://www.advancedclustering.com/hpc-cluster-blog-rhel-7-released/|acá]] |
Tabla de Contenidos
Estructura de implementación de clusters
Para los clustertalca y clustertalca2 la estructura de instalación es estilo Beowulf usando el sistema operativo Linux Rock Cluster, siendo esta, una distribución de Linux basada en CentOS.
La estructura de servidores está basada en un servidor máster controlador (headnode), que se encarga de distribuir los trabajos a través de software especializado a nodos esclavos (slaves), que realizan la tarea sucia de procesar lo encomendado.
Estructura de Servidor Maestro o Headnode
Discos
La constitución de los discos establecidos para los clusters de cómputo de la escuela de Ingeniería Civil en Bioinformática, está normada por la implementación de a lo menos 3 discos que logren permitir la configuración en RAID 5, siendo una de las principales razones de justificación de está medida la búsqueda de protección y rapidez a la hora de almacenar flujos de datos (IN/OUT) en disco.
Una justificación de la aceptación de esta norma se puede encontrar acá
Formato de los discos
En la actualidad los discos duros poseen el formato de archivo ext en su versión 3 (clustertalca) y 4 (clustertalca2). La decisión de esto está tomada por la confianza que entrega el filesystem y el buen rendimiento que entrega en discos de tamaño no mayores a 4TB.
Se estima conveniente explorar a futuro el formato XFS, que en ambientes de computación de alto rendimiento a logrado posicionarse con un filesystem de mucha confianza y excelente rendimiento. Referencia acá